Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms