Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4CQ9C0C4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms