Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPEF2Q9C093 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPEF2Q9C093 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms