Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP1Q9C000 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP1Q9C000 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms