Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM8Q9BZR9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms