Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF3BQ9BZI7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF3BQ9BZI7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms