Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PUS3Q9BZE2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms