Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf16Q9BUW7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms