Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms