Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GINS3Q9BRX5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms