Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF559Q9BR84 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF559Q9BR84 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF559Q9BR84 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF559Q9BR84 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms