Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RETNLBQ9BQ08 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms