Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD1Q99460 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMD1Q99460 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms