Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF13CQ96RJ3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms