Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A9Q96Q91 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A9Q96Q91 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms