Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP3Q96P20 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms