Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF48Q96MX3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms