Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP44Q96MT7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms