Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP53Q96M91 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms