Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VCPIP1Q96JH7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VCPIP1Q96JH7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms