Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK5RAP3Q96JB5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5RAP3Q96JB5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms