Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC124Q96CT7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC124Q96CT7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms