Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms