Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRF1Q92994 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms