Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC4Q8WW27 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms