Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RB1CC1Q8TDY2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms