Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC4Q8TBB5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms