Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HJURPQ8NCD3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms