Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms