Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms