Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf139Q6ZV77 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms