Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CFAP47Q6ZTR5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP47Q6ZTR5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms