Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LIAT1Q6ZQX7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms