Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCBE1Q6UXH8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms