Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms