Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms