Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms