Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBEC3HQ6NTF7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3HQ6NTF7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms