Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMBOX1Q6NT76 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms