Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCSD1Q6JBY9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms