Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTP1Q6DN14 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms