Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms