Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PRPF38BQ5VTL8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms