Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01545Q5VT33 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms