Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOGA3Q5TF21 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms