Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHSL1Q5SYE7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms