Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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