Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP100Q494V2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP100Q494V2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms