Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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