Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms